本标准于2018年立项（项目编号spaq-2018-061），项目承担单位为中国食品药品检定研究院和厦门海关技术中心中心。2018年12月正式启动，2019年2月28日召开食品安全国家标准项目启动会，2019年7月12日至2020年10月19日在广泛调查研究和讨论的基础上，起草了本标准，并邀请10家以上专业技术机构进行方法标准实验室间验证工作，2020年11月30日形成草案，2020年12月1日至2020年12月25日进行行业内征求意见，期间未收到重大分歧意见，2021年2月22日形成《食品安全国家标准食品微生物学检验培养基和试剂的质量要求》草稿。2021年6月24日经第二届食品安全国家标准审评委员会微生物检验方法与规程专业委员会第六次会议审查通过。