本标准于2017年立项（项目编号为spaq-2017-055），项目承担单位为：中国肉类协会与中国食品土畜进出口商会。2018年1正式启动，起草组对国际、国内相关标准情况进行了查询和对比分析研究；向食品检验中心、大专院校、科研院所、行业协会、生产加工企业征询本标准制定的意见和建议。2018年1月25日召开标准起草工作会议。2018年1月25日至6月4日开展标准起草工作，2018年6月4日至8月27日对行业企业开展调研，2018年8月28日召开起草组工作会议，形成《食品安全国家标准畜禽副产品加工卫生规范》（征求意见稿），2019年7月-9月，第一次向社会公开征求意见。2020年5月13日-6月30日，起草组根据预审意见及专家讨论会内容对标准文本、编制说明等材料进行完善，形成送审稿。

2020年9月-2021年7月，起草组根据生产经营规范专业委员会第五次会议审查意见修改完善送审稿文本及相关配套材料，并于2021年7月生产经营规范专业委员会第七次会议审查通过。因调整后的标准文本结构和部分内容与第一次公开征求意见的版本有较大的不同，因此委员会建议重新向社会公开征求意见。