如何进行检索－有机检索

有机检索理念

  为什么又要谈检索，不是因为我有什么新发现，而是我与一些检索高手和新手交谈后，发现了很多问题，如重复检索，需要的时候却检索不到，只了解一些文献数据库，对其它数据库却不了解，密码和代理资源严重枯竭......等等。因此感到很忧虑，于是有感而发写的，希望大家能树立新的检索方式和理念，改变上述现状。

  谈到检索，大家第一想法是查文献，有人便认为是找数据库，有人说是pubmed，都不完全对。检索是一种举动，从最初不懂到懂，这需要一个过程，但许多战友检索水平高了，会找密码和代理了，便认为自己天下无敌了，其实不然，这不是真正的检索高手，真正的检索高手，应该是全方位地了解检索，全方位地、高效地运用你的检索技巧，正如以前一句话：检索让你的生活变得轻松起来！打个比方，为什么检索水平越高，在检索上花的时间反而越多？而且随着你的检索水平提高，你获得文献的速度并未成正比？因为我们都有一些不良的检索习惯，因此今天我倡导的是一种新的检索理念---“有机检索”或叫“生物检索”。这也是我通过长期文献检索获得的经验和教训，希望大家能此为起点，达到一个更高的高度，那么我的目的便达到了。

  为什么叫有机检索或生物检索呢？强调的是有计划，有组织，协调检索过程，使检索变得简单化，高效化，为工作和学习带来更多的便捷。

  首先应该了解为什么要检索，什么东西需要我检索，在什么地方检索？如何高效率地检索到自己的所需？如何应对检索不到的文献和资料？检索后应该怎么做？ 

  具体说一说，希望大家看完这里内容后，能反思一下，自己过去的检索方式，能否需要进一步改进一下？ 

  1 检索的第一步是为什么要检索？
检索是工具，是学习和工作的工具，为更好的学习和工具提供指南，因此我这篇的名字也叫指南针，即源于此。 

  2 什么东西需要检索？
大家多认为是文献，paper。不完全正确，我们真正需要的东西，只有一部分是paper，更多的是其它的东西，这些东西同样需要检索！同样值得重视。因此在检索之前你就应该思考，我检索什么东西。
打个比方，我想作一个PPT，想找一个“cell”或一个mitochondria，那么你怎么找？至少有以下一些答案：
（1）在google上找图片，输入关键cell，OK很好，找到很多你需要的，很方便。但众所周知原因，google搜索到的图片，很难打开。（把google设成英文状态是可以打开的 by daijoan)
（2）输入cell filetypePPT，在google中找，找到专业的PPT作参考。OK，也是好方法之一。
（3）去pubmed, sciencedirect,OVID上去找最新的paper，然后从paper中挑出好看的图作参考。我想以上几种方法都可以实现，但都不是理想的方案，你至少要花一定的时间，可以说你都不是很高效的检索手段。因为有时会存在一时找不到合适的东东的现象，为此许多大虾很迷茫，甚至说昨天我还找到了，怎么今天老找不着呢？搜呀搜，还是找不到！我想大虾级人物经常会遇到这些情况，如果你有，表明你应该更改一下你的搜索理念了。 

  3 在什么地方检索？
当然在数据库。不，在数据库，以及互联网上其它一些地方。大虾级人物可能不以为然，当然了，找全文，可以在数据库中找，可以通过google搜索PDF文件，可以到作者的个人主页上找，或所在研究单位去找，还可以用email去要，也可以去生物谷等网站去求助，还可以找图书馆馆际互借......，但如何有机地处理这些方式，以达到最快找到你所需的东西？方法千万种，但我们需要的是最快的一种！这便是有机检索的精髓。

  如何达到有机，或高效率检索？

  其一，在知识层面上要了解全球数据库的概况，使检索具有方向性和合理性。 

  需要大家熟悉全球大的数据库（不包括个人主页等检索方式了），数据库不仅是文献数据库，如OVID,sciencedirect, human press, blackwell, BP,ACS,CA,BA,还包括专业数据库，如疾病数据库，基因和蛋白质各种数据库等等，这里列了较齐全的数据库集合吧http://www.bioon.com/， 只要找对合适的数据库才能达到有效地检索。如果大家都能对数据库有个大概了解，我想，你的检索水平已经足够高了。当然，检索内容还包括用google对图像，PPT，PDF，等检索（下一代检索也许会用微软的longhorn的新的检索工具了），因此要求大家对检索知识有个初步的掌握，我想我们论坛中有足够多的教程，尤其是入门教程供参考了。千万不要忽视这些入门的东西，对检索高手来说，常温习这些知识同样重要！因为这是检索的基础。
其二，检索不要贪多，一定要精，使检索达到最简化和最优化。

  尤其是检索文献，有人喜欢一次性下载一两百篇文献，所谓“通吃”，最终看了多少？十有八九是浪费！paper是用来读的，不是用来收藏的。如何高效地检索也包括这一点：只要必需的！不是必需的，不必找！同时看paper只看重要的paper，一般的，或比较差的paper最好少看，有时会误导你的思路的。看时要做标记，并且进入你的数据库，至少今后你会大概的印象，你读过这些文献没有？另外，经常见到网上有人求助没有电子版的文章，或一些偏僻的杂志的文章，我不说这些文章一定没有价值，至少大部分时候，我们都可以将这些文章价值忽略！并不是自己必需要的东西，如果没有也不必可惜和遗憾！多读重要的，有创新的paper（大多网上有电子版）。同时也没有必要每一篇都读过去，只读特别相关的，了解一些周边的信息。文献读多了，会被文献套牢了，你没有思路了。相反，一篇好文献，值得你反复回味，多读数遍都可以，一直到读懂，读透为止。
其三，要求一次检索服务终生，使检索效率达到最大化！

  这便是高效！许多朋友在需要时便检索，检索完毕，东东就没了，或者不知道放到哪了，或者随手扔了，下次需要时再检索。但一定要知道，有时候当你需要的时候，它并不容易被你检索到。如何避免这种情况呢，这便是我讲的重点之一。 

  建立自己的数据库是达到有机检索的重要方法之一，也是检索后应该做的主要事情！personal database，或private database。将你所查过的有用信息（因为你现在查了，如果你学习和工作的方向不变，将来可能还会有用），尤其是精华的，有用的信息，及时进行归类整理，相信时间长了，自然便有了自己的小数据库，如果要查什么内容，首先想到的是自己的数据库，如果刻盘，可以随身携带，多么方便快捷，即使不能上网的地方也可以用！其实我们只要细心，就会发现网上有许多试用数据库和免费的内容，但过一段时间后便不免费了，那时再想查这方面文章，就来不急了，甚至你以前查到的内容现在没有了，难道不可惜？如果建立数据库后，便不存在烦恼了。 

  如何建立自己的数据库呢？我讲一点我个人经验供参考。可以在硬盘（不要在C盘）设立一个文件夹，可以进行分类(最好用英文名），如image, protocol,PDF,Note等，然后分别建立下级文件夹，如在image中建立cell, DNA, human, animal, disease等，Protocol 中建立Immune, molecular biology, cellular biology, biochem...，以供实验使用。这个看自己的专业需要而定。而PDF文件，我希望所有的求助者和应助者都应养成一个良好习惯！所有经过你手头的文献都要入库！建议文件采用reference manage或endnote软件进行管理，并进行适当地分类，按软件的编号给你的文献编上相应的序号（如1.pdf, 2.pdf, 3.pdf...)，并将文摘导入到软件中（可以直接导入，如果不会用，可以去下载中心下载软件说明书，很快便能学会）。录入时每篇花个几分钟，这样随时间积累，你的数据库将越来越大，这样查找起来非常方便，只要知道关键词或某个词，便能发现不仅仅是一篇你需要的文章，而是很多，应助别人，帮助自己，都很方便。因此我个人希望我们生物谷的每个人都学会这种习惯，backup your finding。 

  记得与oxworkerman 谈到检索习惯时，他说他每次检索后，都将检索的内容，以及这次检索的经验，或发现了什么好地方，都会做电子版的分类记录，每次几分钟，定期整理一下，时间长了，水平提高了，自己归类能力强了，工作有序了，检索高效了！我想这非常值得大家借鉴和学习。好的检索方式会大大提高你的和大家的工作效率。但如果能将检索到的结果也都备份一下，建立自己的数据库，这样就更方便了！珍惜检索到的文献是很重要的品德。 

  过去称好记性不如烂笔头，现在应该叫高水平不如简化的电子笔记。 

  当然，个人数据库要有机安排。做电子记录和备份，一定不要乱！事先规化好很重要，以后的改动只是作小的修改，不能事先眉毛胡子一把抓，后来自己也搞不清哪对哪了。

  讲到检索理念我不由自主想到检索的密码和代理问题，由于国内的经济状况，许多数据库内容我们无法得到，这也是限制中国生命科学发展的重要瓶颈。因此找代理和密码便变成了大家的焦点。本人作为个人并不反对你自已去找，但我想不应该把寻求代理和密码与检索等同起来！检索是一门大学问，而代理和密码只是技巧而已，如何掌握好检索，这是生物谷和中国生命科学论坛的一个重要目标。有人统计过，在互联网电子资源中，免费资源比重超过90%！对于我们面前的，收费的主要是许多期刊杂志，这些是我们需要的内容。其实有时我们只要看文摘就已足够，因为大部分文章都没有必要花大量时间去阅读全文，而且还存在大量免费期刊，能掌握和了解这些免费期刊上的内容就基本上已满足了大家的需要了，除非特殊情况，非要一些收费期刊不可。若能将检索的好习惯运用起来，我想代理和密码也会得到最高效地应用！也不会象现在一样一个个死去了。